檢查儀器外殼有無破損,內(nèi)部部件是否安裝牢固;
確認(rèn)毛細(xì)管陣列已正確安裝,無翹曲、折斷、連接松動(dòng);
檢查電源接口、數(shù)據(jù)線連接是否穩(wěn)固,配件是否齊全(聚合物袋、緩沖瓶、樣本盤等);
儀器內(nèi)部溫控模塊、激光系統(tǒng)、電源模塊需無異常提示。
啟動(dòng)Data Collection軟件,檢查界面是否能識(shí)別毛細(xì)管陣列編號(hào);
檢查軟件是否能正確識(shí)別溫度、電壓、毛細(xì)管狀態(tài)等;
測(cè)試樣本板加載與彈出動(dòng)作是否靈敏;
檢查樣本板掃描功能是否準(zhǔn)確定位孔位;
確認(rèn)各項(xiàng)運(yùn)行日志、報(bào)警日志是否能正常導(dǎo)出。
激光燈源啟動(dòng)后是否正常穩(wěn)定;
查看檢測(cè)通道(FAM、VIC、NED、PET、LIZ等)是否可被識(shí)別;
進(jìn)行一次無樣本運(yùn)行,確認(rèn)激發(fā)系統(tǒng)無光路偏差。
使用推薦的測(cè)試標(biāo)準(zhǔn),如Thermo Fisher提供的定量DNA Ladder或多重PCR產(chǎn)物;
準(zhǔn)備標(biāo)準(zhǔn)樣本,進(jìn)行實(shí)際電泳運(yùn)行;
檢查毛細(xì)管分離能力是否良好,片段峰形是否清晰、對(duì)稱;
判斷峰位對(duì)應(yīng)的片段長(zhǎng)度是否與理論標(biāo)準(zhǔn)一致,偏差應(yīng)在±1bp范圍內(nèi)。
啟動(dòng)聚合物加載程序,檢測(cè)聚合物是否順利注入毛細(xì)管;
檢查聚合物流速、壓力是否穩(wěn)定,避免出現(xiàn)聚合物殘留或氣泡阻塞;
對(duì)比聚合物粘度設(shè)定值與實(shí)際運(yùn)行表現(xiàn),確保參數(shù)一致。
設(shè)置不同的進(jìn)樣電壓(1.2–1.6 kV)和時(shí)間(10–20秒)進(jìn)行測(cè)試;
檢測(cè)是否存在因進(jìn)樣不均造成的峰形異常;
調(diào)整進(jìn)樣時(shí)間可評(píng)估系統(tǒng)靈敏度與重復(fù)性。
選擇1~3個(gè)已知STR類型的樣本,每個(gè)樣本平行分裝為3份;
采用完全相同的反應(yīng)體系和電泳設(shè)置進(jìn)行分析;
比較每次運(yùn)行所得電泳圖譜中各條峰的位置、峰高、峰面積;
峰位偏差控制在±0.5bp以內(nèi),峰高CV值不高于15%,否則需檢查系統(tǒng)穩(wěn)定性。
使用微衛(wèi)星或多重PCR產(chǎn)物,測(cè)試200–400 bp范圍的片段;
在峰間距為1~2 bp時(shí)是否能完全區(qū)分不同片段;
評(píng)估儀器在復(fù)雜樣本背景下的分辨性能。
ROX 500或600標(biāo)準(zhǔn)品作為片段校準(zhǔn)基準(zhǔn);
比對(duì)每一運(yùn)行中標(biāo)準(zhǔn)峰的實(shí)際大小與預(yù)設(shè)值;
偏差應(yīng)不超過±0.3 bp,大小標(biāo)準(zhǔn)的校準(zhǔn)擬合曲線應(yīng)平滑、連續(xù)。
取梯度稀釋的DNA模板(例如10 ng、1 ng、0.1 ng、0.05 ng)進(jìn)行PCR;
每種濃度電泳測(cè)試,觀察峰值高度、是否出現(xiàn)丟峰現(xiàn)象;
記錄最低檢測(cè)濃度下仍能識(shí)別所有片段的靈敏度;
正常儀器靈敏度應(yīng)達(dá)到0.05~0.1 ng/μL。
使用多重?zé)晒鈽?biāo)記PCR產(chǎn)物,如DS-33染料集;
檢查FAM、VIC、NED、PET等通道信號(hào)是否均衡;
若某一通道信號(hào)顯著偏低,應(yīng)檢查光學(xué)系統(tǒng)清潔情況或激光路徑校準(zhǔn)。
準(zhǔn)備PCR空白反應(yīng)液(不含DNA模板),上樣電泳;
檢查是否出現(xiàn)無源背景峰或污染峰;
空白樣本中如出現(xiàn)明顯熒光信號(hào),應(yīng)懷疑系統(tǒng)存在交叉污染或聚合物殘留。
在兩個(gè)不同STR譜型樣本之間插入純水或空白孔;
如在空白孔中檢測(cè)到與相鄰樣本一致的峰值,則說明存在拖尾污染;
建議更換進(jìn)樣針或清洗樣本加載模塊。
軟件中觀察未上樣孔的基線圖譜;
背景應(yīng)低于100 RFU,如超過此值,考慮光路干擾或緩沖液污染。
安排樣本在不同時(shí)間段、連續(xù)運(yùn)行12小時(shí)以上;
記錄每次運(yùn)行的峰位、峰高、進(jìn)樣狀態(tài)、電壓波動(dòng)等參數(shù);
觀察是否出現(xiàn)信號(hào)衰減、毛細(xì)管堵塞或聚合物流動(dòng)異常等現(xiàn)象。
記錄POP-7在多次運(yùn)行后信號(hào)一致性變化;
分析是否隨著使用次數(shù)增加出現(xiàn)聚合物降解現(xiàn)象;
設(shè)定聚合物有效使用周期(如100次或14天)并進(jìn)行更換提示驗(yàn)證。
啟動(dòng)GeneMapper或GeneMarker軟件,導(dǎo)入.fsa原始文件;
測(cè)試軟件的自動(dòng)峰識(shí)別、校準(zhǔn)、片段命名功能;
檢查結(jié)果圖譜、峰面積計(jì)算是否準(zhǔn)確;
檢查結(jié)果輸出格式(Excel、PDF等)是否支持實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn);
測(cè)試是否能將分析結(jié)果上傳至實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(LIMS);
驗(yàn)證分析模板是否能定制以適配不同實(shí)驗(yàn)需求。
設(shè)備到貨后,廠家通常提供一套驗(yàn)收測(cè)試項(xiàng)目。以下是推薦驗(yàn)收測(cè)試核心指標(biāo):
| 測(cè)試項(xiàng)目 | 評(píng)估指標(biāo) | 合格標(biāo)準(zhǔn) | 
|---|---|---|
| 毛細(xì)管通道檢查 | 所有通道信號(hào)正常,無堵塞 | 8通道/24通道均可工作 | 
| 信號(hào)強(qiáng)度 | 所有熒光通道均能檢測(cè)到標(biāo)準(zhǔn)信號(hào) | 信號(hào)峰值 ≥1500 RFU | 
| 大小標(biāo)準(zhǔn)校準(zhǔn)精度 | 每個(gè)峰定位與標(biāo)準(zhǔn)差距 ≤0.3 bp | R2 > 0.99 擬合優(yōu)良 | 
| 片段分辨能力 | 2 bp 間距能清晰區(qū)分 | 峰形不拖尾、無疊加 | 
| 樣本一致性 | 重復(fù)樣本CV值 ≤15% | 峰位差 ≤0.5 bp | 
| 空白污染檢查 | 空白孔無有效信號(hào) | 全部背景 <100 RFU | 
| 問題現(xiàn)象 | 可能原因 | 解決方案 | 
|---|---|---|
| 電泳信號(hào)消失或很低 | 樣本降解、毛細(xì)管堵塞、聚合物干涸 | 更換樣本、沖洗陣列、更換聚合物 | 
| 信號(hào)過強(qiáng)峰頂截?cái)?/td> | 上樣濃度過高、進(jìn)樣時(shí)間過長(zhǎng) | 稀釋PCR產(chǎn)物、縮短進(jìn)樣時(shí)間 | 
| ROX標(biāo)準(zhǔn)峰漂移 | 熱變性不足、模板變性不徹底 | 重新熱變性處理樣本 | 
| 進(jìn)樣順序錯(cuò)亂 | 樣本板未校準(zhǔn)、軟件設(shè)置錯(cuò)誤 | 重新加載樣本板并核對(duì)樣本表 | 
| 軟件不識(shí)別激光系統(tǒng) | 激光未啟動(dòng)或線路故障 | 檢查連接、聯(lián)系廠家技術(shù)人員支持 | 
賽默飛3500基因分析儀是一臺(tái)性能優(yōu)異的DNA分型設(shè)備,其工作穩(wěn)定性和分析能力依賴于規(guī)范的測(cè)試和調(diào)試流程。通過全面的設(shè)備測(cè)試,包括性能驗(yàn)證、樣本一致性、污染控制、信號(hào)靈敏度與數(shù)據(jù)精度檢測(cè),能夠有效確保儀器長(zhǎng)期高效運(yùn)行,為后續(xù)的實(shí)驗(yàn)分析提供可靠保障。
建議每間實(shí)驗(yàn)室在設(shè)備正式投入使用前完成一次完整的設(shè)備性能評(píng)估,并建立周期性測(cè)試與維護(hù)檔案,以確保系統(tǒng)始終處于最優(yōu)工作狀態(tài)。
          
          杭州實(shí)了個(gè)驗(yàn)生物科技有限公司