蛋白質(zhì)定量是分子生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、藥學(xué)和生物工程領(lǐng)域?qū)嶒灥幕A(chǔ)環(huán)節(jié)。無論是進(jìn)行電泳、免疫印跡,還是進(jìn)行酶學(xué)分析與質(zhì)譜檢測,準(zhǔn)確測定蛋白濃度與純度都是關(guān)鍵步驟。賽默飛NanoDrop Eight分光光度計憑借高通量檢測能力、極低樣品用量及寬廣的光譜范圍,成為實驗室蛋白檢測的常用工具。
本篇將系統(tǒng)介紹NanoDrop Eight在蛋白檢測中的應(yīng)用,從基本原理到操作方法,再到數(shù)據(jù)解讀與實驗經(jīng)驗,全面呈現(xiàn)其優(yōu)勢與實踐要點。
蛋白質(zhì)中含有芳香族氨基酸(色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸),其在280 nm處有明顯吸收峰。通過測定280 nm處的吸光度即可估算蛋白濃度。該方法簡便快捷,但要求樣品較為純凈,且需預(yù)先知道摩爾消光系數(shù)。
在190~230 nm區(qū)間,蛋白質(zhì)肽鍵會產(chǎn)生強(qiáng)吸收峰。NanoDrop Eight的光譜范圍覆蓋190 nm,因此可以通過檢測低波長區(qū)域吸收來輔助評估蛋白濃度。
當(dāng)樣品復(fù)雜、含有雜質(zhì)或緩沖液對280 nm檢測有干擾時,常采用染料法。不同方法的檢測波長如下:
Bradford法:595 nm
BCA法:562 nm
Lowry法:750 nm
NanoDrop Eight能夠在全光譜范圍內(nèi)檢測,因此適用于上述各種方法。
將NanoDrop Eight置于穩(wěn)定的實驗臺,避免震動干擾。
開機(jī)預(yù)熱3~5分鐘,確保光源穩(wěn)定。
檢查檢測平臺,確認(rèn)無殘留或污染。
緩沖液選擇:盡量使用對紫外吸收影響小的緩沖體系,如PBS或Tris。避免高濃度去污劑和有機(jī)溶劑。
樣品濃度:保證濃度在儀器的檢測范圍內(nèi),過高需稀釋,過低可能信噪比不足。
混勻處理:確保溶液均一,避免沉淀或氣泡。
使用與樣品相同的緩沖液作為空白,進(jìn)行基線校正。
不同檢測方法需選用相應(yīng)的空白溶液。
使用移液器準(zhǔn)確取1.5~2 μL樣品,滴加在檢測平臺中央。
避免產(chǎn)生氣泡,確保液滴均勻覆蓋光路。
關(guān)閉樣品臂,立即開始測定。
Protein A280模式:快速檢測純蛋白濃度。
Protein A205模式:基于肽鍵吸收的檢測方法。
Protein BCA/Bradford模式:適用于復(fù)雜樣品和需要染料的檢測。
全光譜掃描:用于評估蛋白樣品的整體吸收特征。
先測空白對照,建立基線。
依次測定各樣品,系統(tǒng)可同時檢測8個通道,提高效率。
每次檢測后,儀器會自動輸出濃度、純度及光譜曲線。
測得吸光度值后,結(jié)合摩爾消光系數(shù)計算蛋白濃度。
該方法適合高純度蛋白樣品,如純化后的重組蛋白。
因肽鍵普遍存在,該方法對所有蛋白普適,但背景干擾較大。
適用于無法使用A280的樣品。
儀器會根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線自動換算樣品濃度。
Bradford法靈敏度較高,適合低濃度蛋白檢測。
BCA法抗干擾性強(qiáng),更適合含有去污劑或鹽的樣品。
280 nm處有明顯峰值,說明蛋白濃度較高。
230 nm峰值過高可能提示有機(jī)物或緩沖鹽污染。
若在260 nm有峰值,需考慮是否存在核酸污染。
原因:蛋白濃度過高,超出檢測范圍。
解決:對樣品進(jìn)行適當(dāng)稀釋。
問題:蛋白樣品在260 nm處吸收強(qiáng)烈,A260/A280比值過高。
原因:核酸污染。
解決:對樣品進(jìn)行核酸去除處理。
問題:出現(xiàn)鋸齒或噪音過大。
原因:樣品體積不足、氣泡或平臺未清潔。
解決:重新加樣并清潔平臺。
問題:同一樣品多次測定結(jié)果差異大。
原因:移液操作不規(guī)范或平臺殘留。
解決:保持一致的上樣操作,每次檢測后及時清潔。
蛋白濃度過低時,建議使用Bradford或BCA方法。
高鹽或含有還原劑的緩沖液對紫外檢測干擾明顯,應(yīng)提前稀釋或更換緩沖液。
僅依賴280 nm單點結(jié)果可能導(dǎo)致誤差,建議結(jié)合全光譜掃描曲線判斷樣品質(zhì)量。
對科研論文或報告,應(yīng)保存完整光譜數(shù)據(jù),而不僅僅是濃度值。
樣品體積需嚴(yán)格一致,避免因液滴大小差異導(dǎo)致誤差。
建議在實驗室建立統(tǒng)一的SOP流程,尤其是對多用戶實驗室。
NanoDrop Eight的8通道設(shè)計非常適合批量蛋白檢測,可大幅縮短實驗時間。
配合自動化移液器使用時效率更高。
每次檢測后用無核酸酶水或70%乙醇擦拭平臺。
避免殘留樣品干固在檢測窗口。
長時間使用后若發(fā)現(xiàn)光譜偏移或數(shù)據(jù)不穩(wěn)定,應(yīng)聯(lián)系廠家維護(hù)。
定期更新檢測軟件,保證數(shù)據(jù)處理功能穩(wěn)定。
實驗室應(yīng)建立數(shù)據(jù)歸檔制度,統(tǒng)一保存結(jié)果。
利用A280法快速檢測目標(biāo)蛋白濃度,結(jié)合純度分析判斷樣品是否可用于下游實驗。
在進(jìn)行ELISA、WB實驗前,使用Bradford法定量蛋白,確保上樣量一致。
使用BCA法測定酶蛋白濃度,再配合動力學(xué)實驗評估酶活性。
檢測重組蛋白或抗體樣品的濃度和純度,保證藥效評價實驗的準(zhǔn)確性。
NanoDrop Eight分光光度計為蛋白檢測提供了快速、準(zhǔn)確、靈敏的解決方案。其優(yōu)勢不僅在于所需樣品體積極少,還在于能同時完成多通道檢測,大幅提升實驗效率。在具體應(yīng)用中,應(yīng)根據(jù)樣品性質(zhì)選擇合適的檢測模式,合理解讀光譜數(shù)據(jù),并保持良好的實驗習(xí)慣。通過積累經(jīng)驗和優(yōu)化流程,研究人員可以更好地發(fā)揮NanoDrop Eight的性能,獲得高質(zhì)量的實驗數(shù)據(jù)。
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